1894년 1월 10일(음력, 이하 같음) 고부에서부터 시작된 동학농민전쟁은 1월 20일의 무장기포이후 황토현 전투 등을 거쳐 5월의 전주화약의 체결로 일단락되는 듯 하였으나 (제1차 봉기), 그 해 9월 일본군의 경복궁 점령과 함께 친일내각이 들어섰다는 소식에 전봉준의 주도하에 축멸왜이를 구호로 삼례에서 재기포하였다. (제2차 봉기) 전봉준이 이끄는 호남농민군(남접)은 여산, 은진을 거쳐 10월초순경에는 강경까지 진격하였으며, 마침 제1차 봉기시에는 무력사용을 꺼려했던 당시 동학교단의 최고지도자인 해월 최시형의 기포령에 의거 충정도, 강원도, 경상도 각지에서 기포하여 충청도 청산에 집결한 손병희가 이끄는 호서농민군(북접)과 합세하여 20여만명의 대규모 연합부대로써 항일구국전선을 결성, 10월 16일경 경천(등잔골)에 야전군사령부를 설치하기에 이르렀다.
한편, 충청도 여러 지역과 공주에서는 남접 농민군의 2차 봉기 이전인 7월 초부터 농민군이 이미 봉기하여 반왜(반일) 싸움을 준비하고 있었으며, 공주에서는 유생출신 공주 창의소 의장 이유상 휘하에 5,200명이 모여 전봉준의 주력 부대에 합류하였다.

농민군 연합부대는 서울로 가는 길목에 자리잡은 공주를 점령하기 위해 10월 21일, 공주전투의 전초전이라 할 수 있는 ‘천안 세성산전투’에서 패퇴후 이틀 후인 10월 23일 ~ 25일의 제1차 우금치전투(이인,효포,웅치전투)와 보름 뒤인 11월 8일 ~ 11일, 4일 간에 걸쳐 동학농민전쟁사상 가장 치열하고 실질적인 우금치전투라고 할 수 있는 제 2차 우금치전투를 치루게 되었다.
10월 23일 이인(취병산)전투에서는 농민군의 숫적 공세에 밀린 일관 연합군이 공주쪽으로 후퇴하였으나 10월 24일 효포전투에서는 해가 지기 전까지 양측 공방이 펼쳐졌으며, 10월 25일 웅치전투에서는 지원군이 가세한 연합군의 반격에 밀려 농민군은 경천방면으로 물러났다.
전열을 정비한 농민군은 보름 뒤인 11월 8일 공주성 2차공격에 나서, 이인과 판치 양쪽에서 공격하여 연합군을 우금치까지 밀어부쳤으며, 다음 날인 11월 9일, 동학농민전쟁사상 가장 치열했고 처절했던 우금치전투가 벌어졌다.
이날 4~50차례의 공방전 끝에 수천명의 희생자를 낸 농민군은 회복하기 어려운 치명적인 타격을 입었으며, 이날 이후 전투는 11일까지 계속되었지만 이미 전면전상태는 아니었다. 당시 전투에 참가한 3만여 농민군중 살아남은 사람은 500여명에 불과하였다. (일본군 후비보병독립제19대대가 이끈 일관연합군 병력은 2,700여명)



공주부근에는 이 우금치 말고도 농민군이 군진을 설치했던 괘등산과 발양, 도장대 등과 치열한 접전을 벌였던 효포, 시화산, 곰티, 남월, 새재 등이 있고, 전투가 너무 치열하여 마을이 온통 파괴 되는 통에 오랫동안 사람이 살지 못했다는 승주골, 은골, 어은동 등이 있으며, 패배한 농민군이 넘었다는 아리고개, 패배한 농민군의 시신이 골을 메우는 바람에 이름이 붙게 된 송장배미 등의 전적지가 있다.